Baumann Gruppe
Wir entwickeln optische Technologien zur Abbildung von Auge und Gehirn
Unsere Forschung konzentriert sich auf die Entwicklung der optischen Bildgebungstechnologie und ihre Anwendung für die biomedizinische Bildgebung. Unsere aktuelle Forschung wird durch den Bedarf an besseren und zuverlässigeren Methoden für die medizinische Diagnostik sowie durch den Wunsch angetrieben, grundlegende biologische und medizinische Forschungsfragen zu verstehen. Unsere jüngsten Forschungsprojekte umfassen die Entwicklung der optischen Bildgebung - insbesondere die optische Kohärenztomographie (OCT), die funktionelle und Multikontrast-OCT-Bildgebung, die multimodale optische Bildgebung und Mikroskopie sowie die angewandte präklinische Bildgebung in Längsschnittstudien von ophthalmologischen und neurologischen Krankheitsmodellen.
Forschungsbereich
Forschungsthemen
OCT Technologies | Translational OCT | Advanced Microscopy & Spectroscopy | Multimodal Biomedical Imaging
Gruppenmitglieder
Gruppenleiter
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| Bernhard Baumann |
PostdoktorandInnen
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| Antonia Lichtenegger | Conrad Merkle |
DoktorandInnen
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| Pablo Eugui | Johanna Gesperger |
Master StudentInnen
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| Maryam Salehi Ravesh |
ehemalige MitarbeiterInnen
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Projekte
- Optical imaging of ocular pathology in Alzheimer’s disease – OPTIMALZ (2015)
European Research Council - Preclinical imaging of the rodent eye with multi-functional optical coherence tomography (2013-2018) Austrian Science Fund (FWF)
Publikationen
Ausgewählte Publikationen
Komplette Liste der Publikationen
- C. W. Merkle, M. Augustin, D. J. Harper, B. Baumann, "Indocyanine green provides absorption and spectral contrast for optical coherence tomography at 840 nm in vivo," Optics Letters 45, 2359-2362 (2020).
- P. Eugui, D. J. Harper, S. Kummer, A. Lichtenegger, J. Gesperger, T. Himmel, M. Augustin, C. W. Merkle, M. Glösmann, B. Baumann, "Three-dimensional visualization of opacifications in the murine crystalline lens by in vivo optical coherence tomography," Biomedical Optics Express, 11(4), 2085-2097 (2020).
- M. Augustin, D. J. Harper, C. W. Merkle, M. Glösmann, C. K. Hitzenberger, B. Baumann, "Optical Coherence Tomography Findings in the Retinas of SOD1 Knockout Mice," Translational Vision Science & Technology 9(4), 15 (2020).
- D. J. Harper, M. Augustin, A. Lichtenegger, J. Gesperger, T. Himmel, M. Muck, C. W. Merkle, P. Eugui, S. Kummer, A. Wöhrer, M. Glösmann, B. Baumann, "Retinal analysis of a mouse model of Alzheimer’s disease with multicontrast optical coherence tomography," Neurophotonics, 7(1), 015006 (2020).
- B. Baumann, C. W. Merkle, R. A. Leitgeb, M. Augustin, A. Wartak, M. Pircher, C. K. Hitzenberger, "Signal averaging improves signal-to-noise in OCT images: But which approach works best, and when?," Biomedical Optics Express 10, 5755-5775 (2019).
Abschlussarbeiten
PhD theses
- Harper, Danielle J., Depth-resolved multi-contrast retinal imaging with high axial resolution, PhD thesis, Medical University of Vienna, 2020.
- Lichtenegger, Antonia, Multimodal visible light optical coherence microscopy for ex vivo brain imaging, PhD thesis, Medical University of Vienna, 2020.
- Augustin, Marco, Multi-Functional Optical Coherence Tomography for Preclinical Retinal Imaging, PhD thesis, Medical University of Vienna, 2018.
- Fialová, Stanislava, High resolution polarization sensitive optical coherence tomography for ocular imaging in small animals, PhD thesis, Medical University of Vienna, 2016.
Master and diploma theses
- Neuburger, Zoe, Diagnostic validity of visible light optical coherence microscopy data compared to histological data taken from Alzheimer’s disease mouse brain tissue, MD thesis (co-supervised by Antonia Lichtenegger and Bernhard Baumann), Medical University of Vienna, 2019.
- Wechdorn, Matthias, In vivo Imaging von retinalen Neovaskularisationen im Mausauge, MD thesis (co-supervised by Marco Augustin and Bernhard Baumann), Medical University of Vienna, 2019.
- Strehn, Simon, Mehrschichtige Streuphantome für die optische Kohärenztomographie, MSc thesis (co-supervised by Martin Gröschl and Bernhard Baumann), TU Vienna, 2017.
- Schirmer, Johannes, Quantitative Messung der Melaninpigmentierung in Rattenaugen, MD thesis, Medical University of Vienna, 2016.